Eine besondere Expertise der Arbeitsgruppe liegt im Bereich des sogenannten Molecular-Modelings, das wir in den letzten Jahren durch Anschaffung mehrerer leistungsstarker Linux- und Windows-Rechner stark ausgebaut haben. Das Molecular Modeling beschäftigt sich mit dem zielgerichteten Design von neuen Wirkstoffen am Computer. Hierzu steht uns die Molecular Modeling Suite der Firma Schrödinger zur Verfügung, die dem "Gold-Standard" in der Life-Science Industrie entspricht. Sobald die dreidimensionale Struktur eines Proteins bekannt ist - das ist bei allen unseren aktuellen Projekten der Fall - können mit einem ganzen Arsenal an Methoden potentielle Liganden für das ausgewählte Target identifiziert werden. Dies beginnt mit dem "in silico" Screening von Millionen an virtuellen Verbindungen im Computer gegen das zu inhibierende Protein bis hin zu KI-Verfahren, die es ermöglichen, eine Quantitative Struktur-Wirkungsbeziehung zwischen einer chemischen Struktur und einer biochemischen Messgröße wie z.B. ein IC50-Wert zu errechnen.
